R语言cowplot介绍

在R中，想把plot绘制的图像拼接到一起通常可以用par(mfrow=c())来实现，但高级作图基本不会使用plot，而是选择ggplot2或者其他工具包，在ggplot2中，想要拼接两个用ggplot绘制的图像是很难的，ggplot的图像合并大多要求使用同一个data.frame，否则就会报以下错误: Don't know how to add ggplot(data) to a plot

cowplot是ggplot2包的一个简单插件，它的目的是为ggplot2提供一个出版级别的主题，使用少量代码即可实现主题统一的修改，如轴标签大小、画图背景。它主要的作用是可以给研究生和博士后更加容易的画图。

除了提供一个修改版本的主题，该包也提供了一些自定义ggplot2图形注释的功能。

cowplot包的源代码在github: https://github.com/wilkelab/cowplot

我个人觉得ggplot2的设计非常不优雅，特别是我不喜欢灰色的背景网格。我觉得它把数据分割开了。例如下面是一个基于mpg数据集的ggplot2可视化结果。

我更喜欢一个干净整洁的布局用于发表。我也更喜欢通过添加元素构建图形。因此，默认的cowplot设计完全没有网格。下面图形的结果跟ggplot2的theme_classic()主题很像，但它们有一些重要的不同之处，特别是字体大小。

特别地，cowplot默认主题和save_plot()函数连接的非常好，输出的pdf已经漂亮地格式化了，不需要其他参数进行设定：